测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序...

胰腺导管腺癌的五年生存率低于5%，是目前主要致死的癌症之一。如何结合多个公开数据库数据分析和挖掘此类癌症临床诊断和预后的关键基因呢？这里就给大家...

0.介绍 本文的数据出自2017年的一篇文章：Seven-CpG-based prognostic signature coupled with...

火山图有误，已更新 前情提要 前面两个步骤已经完成了数据下载、探针过滤、数据质控、样本过滤。 此处需要补充两个知识点： beta值的生物学意义 ...

在step1中，我们获得了TCGA中OSCC 的32个病人的T-N配对样本和对应的临床信息,并将其组成了一个名为my_Load的ChAMP对象。...

4.将差异甲基化位点拿来做批量生存分析 logrank test批量生存分析 这里和TCGA系列里的内容是一样的，详见：两种方法批量做生存分析 ...

TCGA数据的另一个重要的包：RTCGA参考学习资料：TCGA之miRNA预测临床表现RTCGA（1） 数据概况与数据下载RTCGA（2） 数据...

TCGA是研究肿瘤相关机制的重要资源。在线数据库更新改版都比较快，使用时需要参照最新的线上数据教程。不过癌症相关的数据库操作起来也都比较类似，输...