WGCNA原理和分析流程[//www.greatytc.com/p/9331eb5377d1] 单细胞WGCNA分析方法+随机森林[h...
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说在前面 我们在前面通过3篇推文介绍了张泽民老师的系列研究成果张泽民老师系列文章解读(一)[https://mp.weixin.qq.com/s...
老规矩,推荐大家看官网,资料: 官网scMappR:https://cran.r-project.org/web/packages/scMapp...
在单细胞分析当中,经常会遇到整合分析的问题,即去除多样本数据之间的批次效应(batch effect),那么什么是批次效应呢?简而言之,批次效应...
年底复盘,发现很多知识点理解并不深入,想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一化 考虑到文库测序深度的影响,...
hello,大家好,今天我们要再度深入认识一下批次效应,关于批次效应,我们之前分享了很多了,文章列在这里,供大家参考 10X单细胞(10X空间转...
在上篇文章中,我们初步探索了PHATE的使用方法,发现它在揭示一些连续分化过程中不同细胞状态之间的微小局部差异具有很好的效果,同时也能保留细胞全...
hello,大家好,今天周一,做一个简单的汇总,主要针对基因集打分,无论是单细胞还是空间,基因集打分都很普遍,方法也很多,我们来总结一下。 研究...
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1.鉴定细胞状态 以t-SNE图呈现AUC评分和TF表达情况(即调控元件的活动度) 利用AUC 交互app(Scope) logMat <- e...
专题公告
单细胞技术和原理