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GSEA
收录了11篇文章 · 8人关注
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    GSEA和GSVA，再也不用去下载gmt文件咯

    前言 我是在y蜀黍的书里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一个叫msigdbr的包，就是把MsigDB的那些基因集...

    5.9 小洁忘了怎么分身 8 80 1
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    GSEA学习笔记

    春节后的第一次写学习笔记，还是要提醒大家没事别聚集、别聚集、别聚集！重要的事情说三遍！ 前几天看到公众号里写了GSEA的文章，虽然我之前跟着很多...

    3.9 生信start_site 11 71
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    GSEA富集分析的点状图画法（R）

    GSEA运行完以后默认出图较丑，而且只是png格式，不能改字体和大小，分辨率还是可怜的96dpi，就像下面这个图，远看可以，近看不行，远达不到S...

    1.6 欧阳松 6 21
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    GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)

    富集分析方法 ORA Over-representation analysis过表达分析，常见的是GO富集分析和KEGG富集分析； FCS fu...

    1.8 Juan_NF 2 22
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    GSEA 从数据到美图

    0.输入文件和R包 文件有两个，一个是差异分析结果；一个是msigdb数据库下载的gmt文件。 gsea要求的输入数据格式是排序后的logFC值...

    2.1 小洁忘了怎么分身 5 35
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    GEO数据分析之GSEA

    GSEA-analysis 1.加载数据 载入前一步分析得到的表达矩阵 2.批量相关性分析 将第一行目的基因跟其他行的编码基因批量做相关性分析，...

    4.2 天涯清水 2 25
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    GSEA-基因集富集分析

    1.为什么写？ 网上教程一抓一大把，有的能重复，有的不能重复不了，很多原因。别人能做的不代表你能复制，实践出真知。 不做搬运工，只写有用的，防止...

    1.4 生物信息与育种 0 19
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    Day 11 充分理解GSVA和GSEA

    单个基因集的GSEA分析 http://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/index.jsp GS...

    4.2 陈宇乔 6 40
  • GSEA结果解读、原理介绍、操作方法的资料的整理

    视频资料：小张聊科技-bilibili 权威详细文档（英语能力好的这个最佳）：权威详细的pdf文档 R语言环境下的一个例子：https://ww...

    0.3 superqun 0 5
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    GSEA笔记

    GSEA缩写 GSEA的全称是Gene Set Enrichment Analysis，中文翻译就是基因集富集分析，最早提出GSEA的文章是下面...

    4.1 backup备份 0 65

专题公告

GSEA使用的技巧