嗨嗨,好久不见,太久没有更新啦。前几天和老师讨论实验的时候,他提到了这个数据库挺方便,之前只是听说过,没有研究过怎么用,回来之后我就仔细看了下,...
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1、链特异性测序的目的现在二代测序主要有PE和SE两种策略,PE主要用于RNA-seq,SE主要用于小RNA测序(短片段文库测序)。PE测序,我...
1. 什么是位点频谱(site frequency spectrum)? 位点频谱也叫等位基因频谱(allele frequency spect...
[连锁不平衡粗俗的说就是:这几个基因耍流氓,喜欢抱团遗传,不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上,随着物理距离的增大,两个连锁的的等位基因的连...
一、技术原理 基因组研究的维度可以分为很多种,例如下图所示 其中Hi-C是研究三维结构的一种方法。Hi-C技术源于染色体构象捕获(Chromos...
Identity by Descent (IBD) :同源相同片段,是在两个及以上个体存在来源于同一祖先的、未发生重组的、完全相同的DNA片段,...
关于为何要进行SNP的过滤: 第一,低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果,甚至影响后续对生物学问题的解释;第二,群体研究...
基因组中重复序列大体分为两类:串联重复(Tandem repeats,Tandem Duplication) (TRF可预测)散在重复(Disp...
1.stack寻找位点1)数据预处理数据下机经过拆分去接头获得原始数据 由于拆分数据用的引物街头长度不一,获得的原始数据的长度也有差异,这对后续...
RAD-Seq(restriction site-associated DNA sequencing)最开始指的是2008年发表在PLOS ON...