缘起：课题组需要组装一批物种的matK、rbcL与ITS分子标记，用于后续的生态学研究。 对于matK、rbcL与ITS这类常用分子标记...
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缘起：课题组需要组装一批物种的matK、rbcL与ITS分子标记，用于后续的生态学研究。 对于matK、rbcL与ITS这类常用分子标记...
准备物种树和基因树，主要物种树和基因树要保持一致 1. 物种树 （可以用ofrthofinder获得） 2. 基因树 物种树必须包含基因树中所有...
选择压力及基因在进化过程中所受到的压力，也称自然选择。 在遗传学中， Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率（Ks...
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我觉得处理任何事情，不仅要做到“知其然”，还要做到“知其所以然”。在做事情时，如果仅知道低头蛮干，不知道抬头看路；只知道跟着“牵牛绳”的方向，在...
数据准备GeneCount文件包含了所有同源基因组数目不为1的所有基因组，在各个样本中的数目；UnassignedGenes文件则包含了仅包含一...
以下内容参考了博客https://www.cnblogs.com/bio-mary/p/12818888.html、前研究组师妹的总结资料和MC...
参考地址[//www.greatytc.com/p/9d28de3d18e6]Ka/Ks和4DTv用于分析基因组的复制情况，可共线性分...
一、phylogeny总体分析流程 系统进化分析已经是做生物学、生物信息的一项基础分析方法了。确定同源基因、进化历史、基因家族分析、分子进化等都...
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