参考来源生信常用数据格式: FASTA 格式 [https://zhuanlan.zhihu.com/p/34195790]20160406 F...
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前言 康奈尔大学,FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因子 (TF)、转录调节因子 (...
本文主要工作:对SBT基因家族的基因结构进行可视化呈现 4.2 基因结构可视化 可视化基因结构,无非就是展示基因区域的组成:3’,5’-UTR,...
前言做生信的小朋友看到别人文章里面的多序列比对图是不是感觉特别好看,特别养眼,但是让自己去做,出的图真是惨不忍睹,无法直视,被老板ds,没办法,...
Cytoscape是我们日常数据分析中最常用的网络图绘制神器。今天小编给大家推荐一款2D转3D插件 -- cy3d。 图1. 3D网络图 图2....
存储基因和转录本的结构信息,gtf和gff3两种格式都可以。在实际分析时,会需要转换两种格式。比如,NCBI 只提供了GFF格式的下载文件,我们...
MCscanX 软件用来做植物基因的共线性分析, 也可以做复制基因的分类分析,查看基因家族成员是否由 segmental 复制产生。 准备MCs...
05.密度分布图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 基础plot函数绘制密度分布图 ggplot2包绘制密度分布图 ggpubr包绘制密度分布图
转录因子分析的流程 一、从转录因子数据库下载大麦转录因子CDS序列 PlantTFDB - Plant Transcription Factor...
基因家族的概念 基因家族 : 来源于同一个祖先,由一个基因通过基因复制而产生的两个或多个拷贝而构成的一组基因,他们在结构和功能上面具有明显的相似...
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