概要 本文主要讨论Seurat对象导入到Monocle中直接进行分析的可行性，分两种情况：①经过数据清洗、标准化和聚类的Seurat对象导入②未...

梗概 参照官网教程：http://cole-trapnell-lab.github.io/monocle-release/docs/#getti...

接着上篇继续练习，前一篇文章里已经把PBMC按照4个时间点分了群，接下来就是差异分析了。本次使用monocle进行差异分析，主要分10步（使用m...

刘小泽写于19.10.17笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索10X Genomics技术相关的分析课程链接在：http://jm.g...

Garnett是一个从单细胞表达数据中实现自动细胞类型分类的软件包。Garnett的工作方式是获取单细胞数据和细胞类型定义(marker)文件，...

刘小泽写于19.9.5-第三单元第十一讲：使用monocle2分析文章数据笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术...