GSVA基因集变异分析结合limma包分析差异基因集 基因集变异分析即GSVA(Gene set variation analysis),是一种...
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之前在twitter上看见一个老哥开发了一个网站 sra-explorer,大致意思就是能够解析你输入的SRA号,比如说GSEXXX,SRPXX...
知识的学习没有一蹴而就,没有捷近,扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述,全面而详细!深度好文,可用来反复阅读。初学者用于把...
NGS原理图大全-计划涵盖大部分Genome-Transcriptome-Translatome-tRNA-smRNA有关的技术。目前加粗字体的...
题目来自生信技能树论坛 做题之前我们先看看文件的内容是什么 gtf有9列1.染色体名 2.注释信息的来源,比如”Genescan”、”Genba...
这个时候已经不是表达矩阵的事情了,要从新从fastq测序数据开始。对测序后的fastq数据进行转录本的组装。基于组装后的转录本,通过数据库注释去...
RNA-seq分析简洁版[//www.greatytc.com/p/72c871663e62],用重新下载的肝癌数据[https://...
背景 feature 定义:基因组上对具有不同性质区域的定义 (例如:gene/exon/intron/miRNA等)。 优点:利于分类整理结果...
RPM/RPKM/FPKM/TPM是我们在定义表达量时常用的几种计算方式,那么究竟有什么区别呢? RPM/CPM RPM/CPM: Reads/...
刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析,得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存在不准确性,推荐使用TPM。 ...
专题公告
seq数据分析