论文 A latitudinal gradient of deep-sea invasions for marine fishes https:...

本文整理至ggtreeExtra文档，仅用于学习 作者：Shuangbin Xu and GuangChuang Yu链接：https://bi...

富集分析是生物医学论文中非常常见的一类分析，例如GO富集分析，Pathway富集分析等。其结果一般包括以下几个要素：1，名字（GO term或者...

R Markdown 是Markdown在R中的延伸。除了具备一般Markdown 语法功能之外，最关键的是可以在Rmarkdown 中插入代码...

热图（heatmap）在生信领域基本就是常规操作，基本技能，入门操作。能画热图的工具也有很多，我自己常用的R包是pheatmap。 最近经常看见...

今天分享另外一个最近学习的一个画图的小技巧。 说到网络图的绘制，大家可能首先想到的是Cytoscape，它在生物学相关的领域应用非常广泛，我自己...

桑基图，其实我用的不太多。最近常见还是在分析单细胞数据的时候，展示细胞通讯用的比较多的一种类型的图。例如下面一张就是cellchat画的一张桑基...

前面一个帖子我们学习了画基本的PCA图形，但是是二维的，今天我们学习绘制三维的，因为在有些paper中看到作者放的是三维的，其实也挺好看的。主成...

前面，我们仔细学习了Alpha多样性的一些常见指数，今天我们尝试用R来计算这些常用指数。 library(vegan) library(pica...

今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中，可以看出，图片分成2个部分，左边是进化树，右边是类似气泡图。 下面我们用一组简单的文件进行...