差异基因鉴定 基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异，最简单的标准化方式是计算counts per million (CPM)，即原始read...
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差异基因鉴定 基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异，最简单的标准化方式是计算counts per million (CPM)，即原始read...
============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[ht...
最近在写进行转录组数据的分析文档，前面介绍了如何根据差异基因绘制火山图，今天来介绍如何通过clusterProfiler包对非模式物种进行KEG...
作者：童蒙编辑：angelica 由于基因一般有别名、或者因为excel的转换、人为错误等其他原因，使得基因名容易有错误。对于人和小鼠，有标准名...
作者：oct审稿：童蒙编辑：amethyst 配对差异分析经常应用在肿瘤配对样本的差异分析中。在肿瘤研究中，通常需要进行肿瘤组织与相邻正常组织之...
生物医学研究中总免不了对单基因或是某基因家族的分析，这样“优秀”的基因需要在疾病表达、临床病理特征、以及其他生物层面具有显著的意义，如免疫相关、...
lncRNA是个神奇的分子，被研究了很多年，可依然还有大量的高分文章发表。小编收集了2020.06以来的lncRNA文献，发现超过10分的机制文...
通过前期的基因定量，我们通过RSEM或者Kallisto这些工具得到了每个基因或者转录本的表达量矩阵。输出的矩阵包含了基因以及在各个样本中的表达...
作业要求 我们统一选择p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因为显著差异表达基因集，对这个基因集用R包做KEGG/GO超几何分布检验分...
最近读到一篇博文，介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简要整理并对相关评论内容进行大致...
专题公告
转录组分析入门
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