RNA-seq数据下载 数据来自文献：An RNA-Seq transcriptome and splicing database of neu...

前言 ENCODE项目团队发表在PNAS上的文章表示：通过数据分析基因的表达水平在同一个物种不同组织间的相似性比不同物种的相同组织还要高。这与之...

前言 我们统一选择p<0.05而且abs(logFC)大于1的基因为显著差异表达基因集，对这个基因集用R包做KEGG/GO超几何分布检验分析。然...

前言 转录组入门(7)： 差异基因分析这个步骤推荐在R里面做，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也可以走走e...

前言 实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本都会输出一个表达量文件。需要用脚本...

前言 比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2，并且搞懂它的用法。直接去hisat2的主页下载index文件...

前言 来源还是生信技能树。 需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试测序文件的质...

前言 本课程来源于生信技能树。 本系列课程学习的文章是：AKAP95 regulates splicing through scaffoldin...