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5篇文章 · 4420字 · 21人关注
  • 理解autodock分子对接思路和流程

    总结 准备工作: 设置工作目录,用pymol去除水分子,分离蛋白和小分子,得到各自的pdb文件。 (如果是预测得到的蛋白pdb,那就直接拿来用咯...

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    分子对接没搞明白的地方:gridbox的设置

    以下是查到的资料,目前似懂非懂。关于对接盒子的设置 是分子对接的一个重要参数。分子的大小可以通过回转半径Rg有效地描述,Rg是广泛使用的分子尺寸...

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    10分钟获得小分子三级结构(.pdb)

    开心,打开公众号后台竟然有700粉丝咯,感谢大家的关注和分享,公众号日更永不断~~~ 获得本文所需软件:在生信星球公众号(文末有二维码)后台回复...

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    蛋白质三维结构预测、结果解读与评分

    蛋白质三维结构预测,只要有目的基因的氨基酸序列就可以做,不限物种,没有太多要求,可为文章增色。windows版本的VMD软件可在公众号生信星球回...

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    Autodock分子对接完结&总结

    1.Grid (1) 打开蛋白,“Grid->Macromocule->Open”,打开“r.pdbqt”。弹出的对话框,点击Yes及确定 (2...

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