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  • 利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树

    if [ -f "./env.sh" ]; then source ./env.sh else echo "env.sh file not in...

  • 查看p的基因有没有突变

    1. RNAseq回帖到CDS序列 2. 2代数据回帖到基因组序列 将对应的cds/rna.bam和gene_genome.fa/gene_ge...

  • Resize,w 360,h 240
  • getorganelle组装报错

    get_org.log.txt日志文件 导致无法成环,查看extended_spades/K105下面的slim.log.txt日志, 发现BL...

  • circos图的文件准备

    chr长度文件 gc含量 计算每个窗口基因条数 track1,基因在染色体上面的正负链 突出显示的基因位置 重复序列含量 link 然后用cir...

  • 接上,pcoc检测氨基酸性质的趋同

    pcoc检测 step1. 处理树文件;将第2步生成的02_Trees文件夹拷贝到当前目录,并修改为.txt结尾 step2:处理序列文件 st...

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    hifi+hic组装基因组

    1. hifi结合hic数据进行初步组装 运行结束后生成的一系列文件中,我们只需要关注如下几项 (prefix表示前缀) prefix.bp.r...

  • 趋同检测1

    1. 利用rbh的方法鉴定ortholog 2. 利用convgent_1.2.py生成prank,convert_paml,run_paml和...

  • genblastg和genewise鉴定缺失基因

    基于组装好的基因组,例如某一个基因在该基因组中无注释,需检查是否为注释错误,还是该基因本身缺失。 软件:genblastg和genewise g...

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