25篇文章 · 8478字 · 3人关注
TCGA数据分析 (1) : 如何从TCGA下载数据TCGA数据分析 (2)：如何从TCGA检索数据TCGA数据分析 (3)：RNA-seq表达...
1.提取miRNAs 2. 由starbase API数据库进行下载(10s检索完成） 3.将所有的miRNA靶基因进行合并整理 每个文件都有这...
1.提取这298个lncRNAs的symbol 2. 由starbase API数据库进行下载 不到一分钟将全部lncRNA可能结合的miRNA...
1.加载R包 2. 选择变量 3. 画图 a. 2张图 b. 3张图 **c. 4张图 此外还可以使用在线制作Veen图： Draw Venn ...
找数据 首先在NCBI FTP网站上找到自己需要的数据https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/...
参考文章：https://www.cnblogs.com/liaohuiqiang/p/9380417.html 本文的初衷是对之前建立的sna...
接之前的文章RNAseq分析流程：从测序Rawdata到Count输出一次snakemake分析数据的经验官方文档用snakemake写分析流程...
在之前学习snakemake的基础上，这里重新又对之前编写的pipline进行了优化，只需要在config.yaml中输入相应的samples，...
参考文章：http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/https://cloud.tence...
文集作者
