转录组学习 - 文集

转录组学习

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转录组有参分析之STAR比对及可变剪切
转录组有参分析之STAR比对及可变剪切 STAR比对的特点：速度快准确度高 3'reads soft clip genomeLoad Loa...

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有参转录组学习七：基因功能注释及富集分析
Author: ligc Date: 19/5/18 数据来源参考文章 1.//www.greatytc.com/p/fb15249...

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有参转录组学习六：差异表达分析
Author：ligc Date：19/5/18 DEG differential expression genes input1 input2...

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有参转录组学习五：reads计数
Author：ligc Date：19/5/15 在基因水平上，常用的软件为HTSeq-count，featureCounts，BEDTools...

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有参转录组学习四：序列比对
Author：ligc Date：19/5/15 下载index 进入hisat官网http://ccb.jhu.edu/software/hi...

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有参转录组学习三：参考基因组及基因注释
Author：ligc Date：19/5/15 下载参考基因组我们的实验对象是小鼠(Mus musculus),所以进入UCSC官网下载小鼠...

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有参转录组学习二：数据质控
Author：ligc Date：19/5/15 1.1 fastqc结果解读：测序量：300M左右reads长度：51bp 测序的adapt...

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有参转录组学习一：软件安装及数据下载
Author：ligc Date：19/5/15 参考文章： AKAP95 regulates splicing through scaffol...

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转录组测序原理
Author：ligc Date：19/5/12 1. 一代测序(Sanger sequencing) 双脱氧链终止法采用DNA复制原理。 Sa...

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