这篇文章更多是记录性质的,因为没有详细说明如何从WGDI, MCScan, MCscanX中获取基因对,也没介绍如何整理出记录基因坐标的bed文...
在如何用WGDI进行共线性分析(上)[//www.greatytc.com/p/a50548e81ac0], 我们基于blastp的结...
使用conda安装 使用时需要启动环境 在此基础上可以更新到最新版的JCVI (Github版本会不断的增加新功能并修订bug) 安装额外的依赖...
本教程借鉴https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version). 我们...
JCVI的使用基本格式为python -m jcvi.模块.子功能 实际操作,因此了解JCVI的模块能够帮助我们去找到需要的功能。根据JCVI的...
JCVI是利用Python编写的,能用于基因组组装、注释和比较基因组学分析。之前写过几篇介绍它的使用,这篇单独介绍它的安装。此外,虽然JCVI最...
在「JCVI教程」编码序列或蛋白序列运行共线性分析流程(上)还是有一个尴尬的事情,就是只用到两个物种,不能展示出JCVI画图的方便之处,因此这里...
这是唐海宝老师GitHub上的JCVI工具的非官方说明书。该工具集的功能非常多,但是教程资料目前看起来并不多,因此为了能让更多人用上那么好用的工...
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