在上一篇笔记里,练习了使用cellranger aggr整合不同GEM well的样品(cellranger使用的初步探索(3)cellrang...
在学习cellranger aggr这一步之前,还是需要再一次复习10x Genomics的测序原理。在cellranger aggr部分,官网...
在上一篇笔记的结尾处,提到了cellranger count这一步,之前几天我一直是用的服务器里128G和200G的内存试着运行这一步,并且限制...
本篇笔记是按照单细胞天地公众号教程里的代码练习的,因为之前了解到cell ranger运行需要大量的内存,无奈自己的电脑配置不行,现在有了服务器...
系列回顾:1.RNA velocity分析练习(一)文件下载以及预处理2.RNA velocity分析练习(二)软件安装3.RNA veloci...
系列回顾:1.RNA velocity分析练习(一)文件下载以及预处理2.RNA velocity分析练习(二)软件安装 Velocyto软件针...
系列回顾:1.RNA velocity分析练习(一)文件下载以及预处理 要获取我们需要的loom文件,你需要先安装以下文件: 首先要求你的pyt...
目前有多种方法可以进行RNA velocity的分析: scVelo(参考文章:单细胞转录组数据分析|| scVelo 教程:RNA速率分析工具...
在之前的一个视频学习系列笔记里,有一篇笔记提到了RNA velocity(Single cell RNA-seq data analysis w...
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