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注:此PPT来自上海交通大学附属第六人民医院陈璐老师的讲座,侵权删。陈老师主要做代谢疾病的,讲座中提到的两个工具可下源码:https://git...
以前的笔记,草稿箱忘发
简单记录下。 omicsbean由金弗康公司开发,推出较早,好像是2015年。 R shiny实现,基本无创新,针对小白,收费。以单组学绘图为主...
mGWAS(metabolome-based genome-wide association studies)的研究方法和GWAS类似,只是将代...
最近打算开始写一个多组学(包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组)关联分析的R包,避免重复造轮子,在开始之前随便在网上调研了下目前已有的R...
MIMOSA2: 基于微生物组和代谢组数据的整合分析
概念 利用蛋白质组学数据,结合基因组数据(DNA)、转录组数据(RNA)来研究基因组注释问题,被称为蛋白质基因组学。“蛋白质基因组学”一词由Ja...
如果实验设计已做好,并含有多个组学,只需样本一致即可(最好同时同地同批次)。尤其是转录-蛋白关联,样本要一一对应。对于代谢和微生物组,样本可以不...
主要用于数据预处理和可视化作图,几乎没有多组学关联部分,只是单独对多个组学数据进行处理。支持expression microarray, RNA...
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