1、什么情况下用RNAseq RNAseq是一种高通量测序技术。它可以帮助我们理解在各种比较条件下,所有基因的表达情况的差异。简单的理解,就是R...
1、在R中安装DESeq2软件包 官方网站 2、运行 准备工作 DESeq2 进行差异分析 可视化展示 画火山图 差异基因的提取 根据第1列是G...
featuresCounts 软件用于定量,不仅可以支持gene的定量,也支持exon, gene bodies, genomic bins, ...
RSEM RSEM是对基因进行表达定量的一个软件,是基于STAR序列对比的基础之上进行的。而kallisto不需要进行比对可以直接定量。 安装 ...
安装 conda install STAR 建立索引 STAR--runThreadN6\--runModegenomeGenerate\#工作...
以上两张图是fastqc的结果,都表明样本序列中是含有接头序列的,adapter content的结果为fail。必须去接头才能进行下一部的序列...
multiqc可以整合其它软件的报告的软件,能将fastqc生成的多个报告整合成一个报告的软件,这样能方便的查看所有测序数据的质量。 Multi...
本次实战我采用的是B站某教程上的拟南芥数据,教程链接:https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN...
RNAseq是一种高通量测序技术。它可以帮助我们理解在各种比较条件下,所有基因的表达情况的差异。可以检测的差异有:正常组织和肿瘤组织的之间的差异...
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