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这里是佳奥！我们继续非模式种转录组的下游分析。 上篇我们拿到了raw count矩阵，但是我们还缺少很多东西，让我们一步一步来。 1、选择合适方...
这里是佳奥！经历了一个学期，做了几遍转录组，感受颇深。 原理没变，方法没变，但是思维需要转变，我们需要时刻保持清醒： 做自己的项目不再是机械的重...
首先要获取表达矩阵数据： 然后就导入R开始分析吧！ 1 差异分析 airway、DESeq2、edgeR 参考代码在这里： DESeq_DEG：...
1 导入R 获取矩阵后正式开始下游分析。 2 绘图 相关性图 相关性热图 后续我们使用airway包的数据进行后续分析。 安装airway ：B...
这里是佳奥，让我们继续转录组分析的学习！ 常用的软件：hisat2、subjunc、star、bwa、bowtie2（主要针对基因组）等 1 s...
这里是佳奥！继续转录组分析的学习。 一般我们都是从.fq文件开始的，但是如果是自己寻找数据的话，要多一步骤。 1 获取fastq数据 1.1 s...
使用conda安装 查看环境内安装软件 已安装的软件： trimmomatic、cutadapt、trim_galore star、hisat2...
这里是佳奥，终于来到了转录组分析部分，让我们开始吧！ 1 数据资源下载，参考基因组及参考转录组 gtf genome.fa 1.1 确定项目物种...
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