Avatar notebook default
12篇文章 · 7980字 · 5人关注
  • Small RNA 专题(三)

    miRNA 命名规则: miRNA 简写成 miR,根据其被克隆的先后顺序加上阿拉伯数字,如 miR-21; 高度同源的 miRNA 在数字后加...

  • GWAS系列--从hmp格式基因型到 Structure 格式转化

    一个脚本,解决从基因型到运行 Structure 软件所需要的格式: 有问题讨论!

  • 使用 NCBI PubMed 按影响因子搜索文献

    日常学习中,我们经常需要查阅一些文献,这里分享一个 NCBI PubMed 按照影响因子筛选文献的技巧。 1. 准备影响因子文件 SCI的影响因...

  • ensembl ID 格式化

    一个傻逼型的 id 格式化脚本。不知道同志们有没有遇到这种问题。基因ID带版本号。 格式化 gtf 文件中 ID。 提取 gene2tr 信息:

  • 实用便捷小程序--由从gff文件提取exon/intron坐标信息

    自己动手,丰衣足食。看不懂 的留言,讨论!

  • InterProscan 输出格式

    InterProscan 是一个比较强大的核酸/蛋白序列注释程序。使用命令入下: tsv 输出格式如下: 很好,很强大的功能~

  • small RNA 专题(一)

    最近这段时间一直在开发small RNA的标准分析流程,先Mark一下,随后填坑!到了填坑的时候了: Small RNA在测序分析的时候两个关键...

  • perl 编程技巧

    Perl 是目前我最熟悉的工作语言,perl中有很多特别实用的小技巧下面我就一一罗列一下: -w-w 启用警告,这是perl最基础的一个用法,一...

  • 生物信息与编程系列--引言

    干生物信息工作的如果你没有掌握一门编程语言都不好意思给别人开口说你在做生物信息。在我的意识世界里,生物信息学科是一门纯粹的工具学科,其发展的所有...

文集作者