文献解读-肿瘤测序-第二十七期|《敲减通过控制TOP2A下调的NUSAP1可以抑制人胶质母细胞瘤的细胞增殖和侵袭》

关键词:肿瘤测序;基因测序;变异检测;

文献简介

标题(英文):Knockdown of NUSAP1 inhibits cell proliferation and invasion through downregulation of TOP2A in human glioblastoma

标题(中文):敲减通过控制TOP2A下调的NUSAP1可以抑制人胶质母细胞瘤的细胞增殖和侵袭

发表期刊:Cell Cycle

作者单位:山东大学齐鲁医院等

发表年份:2022

文章地址:https://doi.org/10.1080/15384101.2022.2074199


图1 文献简介

多形性胶质母细胞瘤(GBM)是最恶性的原发性人脑肿瘤类型,其特征是增殖率高,预后不良,其中 5 年生存率仍然低于 5%。在过去的40年中,已经实施了多种治疗方式来提高生存率。然而,由于GBM的高侵入性,肿瘤组织不能通过手术完全切除,从而导致肿瘤复发。

核仁和纺锤体相关蛋白 1 (NUSAP1) 是一种不可或缺的有丝分裂调节因子,据报道参与几种类型癌症的发展、进展和转移。

在本研究中,研究者研究了NUSAP1在人GBM中的表达和功能。研究者首先分析了公开数据库中的分子和临床数据,发现NUSAP1表达在GBM组织样本和GBM细胞系中显着上调。随后,在体外和体内模型中使用敲低策略来探索NUSAP1在GBM中的功能,并鉴定可能介导NUSAP1功能的共调控分子,例如拓扑异构酶2A(TOP2A)。该研究的研究结果为治疗GBM的新型靶向治疗提供了一种潜在的策略。

测序流程

样本转录组分析过程中,研究者使用Sentieon软件进行SNV和InDels检测分析。


图2 sentieon的作用


图3 NUSAP1表达在高级别胶质瘤中上调,并与胶质母细胞瘤患者预后呈负相关

Sentieon软件团队拥有丰富的软件开发及算法优化工程经验,致力于解决生物数据分析中的速度与准确度瓶颈,为来自于分子诊断、药物研发、临床医疗、人群队列、动植物等多个领域的合作伙伴提供高效精准的软件解决方案,共同推动基因技术的发展。截至2023年3月份,Sentieon已经在全球范围内为1300+用户提供服务,被世界一级影响因子刊物如NEJM、Cell、Nature等广泛引用,引用次数超过700篇。此外,Sentieon连续数年摘得了Precision FDA、Dream Challenges等多个权威评比的桂冠,在业内获得广泛认可。

文献讨论


图4 文献讨论

在功能研究中,敲低NUSAP1抑制了GBM细胞在体外和体内的生长。最后,NUSAP1的缺失触发了细胞凋亡,这可能是由于TOP2A的同时缺失所致。这些结果表明,NUSAP1可能在人类GBM的发展中起到癌基因的作用,并可能作为该疾病治疗的一个新型分子靶点。

总结

综上所述,该研究证明了NUSAP1可能通过触发细胞凋亡来抑制体外和体内GBM细胞的增殖和侵袭。诱导细胞凋亡可能是由于伴随TOP2A表达的下调。因此,该研究为NUSAP1在人GBM发展中可能的致癌作用提供了新的见解,并进一步证明了沉默NUSAP1在恶性人脑肿瘤中的治疗相关性。

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