少年时期的卡卡西与宇智波带土、野原琳为木叶忍者学校的同期学员，后来三人先后被分配到波风水门所带领的班级。少年时期的旗木卡卡西是个优秀的忍者，但由于他的父亲（旗木朔茂）为救同伴破坏规矩最后自我了断的惨剧在他心底留下了阴影，导致卡卡西过于严格遵守规定，无论被分配到哪一班都会和同伴起矛盾。
卡卡西的父亲旗木朔茂在一次执行任务中，为救同伴选择了放弃任务，结果给村里带来了巨大的损失，他的父亲受村人仇视，就连所救的伙伴也反过来指责他，最后自杀身亡。这给幼时的卡卡西的心理带来了巨大的阴影，使他变得冷漠，相信任务大于伙伴，终日一个人孤独的生活。
直到带土的出现，带土的善良热情，对于伙伴的珍视，这些都卡卡西都看在眼里，虽然二人经常斗嘴，但卡卡西早以视带土为伙伴，但此时父亲自杀的阴影还残留在卡卡西的心里，他极力克制自己，在父亲墓前，他说：“爸爸是为了同伴才破坏规定的吧……我也有同伴了。但是，我不会像爸爸那样……我会遵守规定。”此时的卡卡西被困在名为同伴的问题中，当琳被掳走时，卡卡西也第一时间选择完成任务，但带土的一番话以及对其父亲的肯定，终于像一束光照进了卡卡西的内心，让他不再束缚在父亲死亡的阴影中，刚走出阴影的他却又面对了挚友带土的惨死，琳的自杀，卡卡西失去带土和琳这两位同伴而大受打击，关不掉的写轮眼，洗不干净的手成了他永远的噩梦。
然而就是拥有这样悲惨经历的人却从未堕落，他是时刻坚守着本心，那些痛苦的经历教会他的不是仇视这世界，而是去珍惜身边的每一个同伴。他是一个随时都可以为了保护村子和同伴献出生命的人，从未退缩也从未停下贯彻火之意志的脚步。
