第一步:安装
docker image pull yaanlpc/rgaugury:2.2
第二步:挂载目录并使用测试数据
docker run -it --mount=type=bind,source=/40t_1/caix/software/database/pfam,target=/opt/pfam --mount=type=bind,source=/40t_1/caix/software/database/interproscan-5.60-92.0,target=/opt/interproscan --mount=type=bind,source=/40t_2/dockers/DataRGAugury,target=/root/input yaanlpc/rgaugury:2.2 /bin/bash
注意:需要提前下载好interproscan和pfam数据库。需要预测抗性基因的蛋白文件存放到个人目录/40t_2/dockers/DataRGAugury,输出结果也在此目录。