2024-05-10

进入bamtofastq所在文件

cd /opt/cellranger/apps/cellranger-7.1.0/lib/bin

进入bamtofastq文件夹下

./bamtofastq

将/mnt/NAS/rawData/HRA003040/HRR_752349.bam* 的bam文件转换成fastq格式并输出到/mnt/NAS/HRR_7552349_fastq

./bamtofastq /mnt/NAS/rawData/HRA003040/HRR_752349.bam* /mnt/NAS/HRR752349_fastq

等待完成后，将上述代码中bam文件序号修改成下一个需要转换的文件序号，输出文件也需修改

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