文件修改后，通过git add来暂存之前修改的内容

$ git add -A .

然后再次执行git status时，却提示no changes added

$ git status
On branch coding-pages
Changes not staged for commit:
  (use "git add <file>..." to update what will be committed)
  (use "git checkout -- <file>..." to discard changes in working directory)
          modified:   themes/next (new commits)
no changes added to commit (use "git add" and/or "git commit -a")

遇到这种问题只好google一番：
如果你想执行git add -A，那在每个子模块中，你应该：

$ git submodule foreach --recursive git add -A .

然后，你要在每个子模块中创建一个commit

$ git submodule foreach --recursive "git commit -m 'Committing in a submodule'"

这样你就可以git add，git commit了。

在 stackoverflow 上说并不推荐这种做法，应该每一个子模块被看成是一个独立的库来处理。
使用git add -A . 命令是直接添加了git库,而不是添加git子库。这个问题通常出现在你想添加其他git库的文件到你自己的库并直接使用git add命令去暂存它，如果换成git submodule add <REPOSITORY-URL>则可避免此情况发生。如果说你很想将其用submodules的方式储存的话，我强烈建议你在将其移除出你的库，并提交删除，重新用git submodule add的方式添加。

附上链接：git add -A is not adding all modified files in directories