为准确了解某种蛋白功能,除需对其蛋白结构进行分析外,通常还需清楚其亚细胞定位,以此判断其发挥功能的可能场所。就该问题而言,生物学中最常用的方法是给待研究的目的蛋白进行荧光标记,其中最常见的荧光标签为绿色荧光蛋白(GFP)和红色荧光蛋白(RFP)。
一、什么是融合表达?
通过基因构建,将两个独立蛋白的编码基因变成一个完整的阅读框,在表达过程中,宿主会将这两个基因当作一个融合基因,从而表达出一个完整的大蛋白。
OliC(启动子)和 TrpC(终止子)共同启动目的基因和GFP的融合表达和终止表达,利用GFP发光地位目的蛋白。
二、利用GFP融合蛋白法进行蛋白质亚细胞定位
- pC-NEO-N/CGFP载体-- 平板划线法培养大肠杆菌细胞 →大提质粒
- GFP+ 目的基因(N端GFP),目的基因+GFP(C端GFP)
- N端GFP的引物设计(46bp)--
F引物: 20bp载体序列+6bp酶切位点+目的基因的前20bp序列
R引物: 20bp载体序列+6bp酶切位点+目的基因的后20bp的反向互补序列 - C端GFP的引物设计(46bp)--
目的基因的编码区去除终止密码子后设计扩增引物,此后同N端GFP的引物设计 - 提取WT菌株的 RNA 并反转录成 cDNA,以WT 菌株的cDNA为模板进行PCR扩增,将扩增产物连接到 GFP基因起始密码子的前面,构建成目的蛋白与GFP 的融合表达载体
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载体使用限制性内切酶 SacⅠ和 XbaⅠ双酶切(双酶切可减少未被切开的载体,降低假阳性)