石蜡切片.jpg
上图所示的石蜡切片中,包含多种细胞类型,但我只想框定一个范围对特定细胞类型(导管)进行统计分析,在ImageJ中怎么操作:
1.将图片拖拽到ImageJ界面打开
2.将图片转为灰度图
ImageJ菜单栏中Image--Type--8bit
图片2.jpg
ImageJ--Adjust--Threshold在弹出的框中轻微拉动滑条调整,让细胞与细胞之间的界线更加清楚,不要有红色粘连 ,对比两幅图,第2张为调整之后,细胞之间的界线更加清晰。
图片4.jpg
图片5.jpg
调整好后关掉小窗口--点击菜单栏第一个矩形框--框出想要统计的范围
框好后,Ctrl+T--more--specify--设定框的大小--OK
图片6.jpg
计算 Analyze--Analyze Particles--第一个框是设定大小,第二个是设置圆的曲率,如果默认参数,就会出现:被红色标记的所有细胞都被计数并计算面积。
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解决方法:在步骤3,调整好细胞轮廓的边界后,先用菜单栏中的第四个多边形工具,描绘出想要框定范围内的,最小的细胞,或者最大的细胞,点击M测量。
我这里想统计面积较大的导管,所以描出范围中看着最小的导管,得到一个最小面积界定。记下来用于设定size。
再进行步骤4的操作。
图片9.jpg
图片10.jpg
这样就可以只筛选框定范围内的特定的导管细胞的面积,和个数。
Results中展示统计的细胞数目,面积信息,一次设置不好,可以叉掉Results,返回步骤5进行重新调整参数。
整理记录一下,希望可以帮助到更多的人
另外,ImageJ在操作过程中怎么撤销上一步的操作呢?一直没有找到撤销的快捷键或者方法。。。。。。