MappedByteBuffer 读取多个超大文件

起因

女朋友用matlab跑出来256个大文件,每个文件300M,每次做数据处理的时候需要读取每个文件的指定行,作为一个数据,也就是说,第一份数据就是这256个文件中的第一行,每行读取出来之后进行一定的格式改变,然后写入到文件中。

思考

  • 为了先让她可以跑测试数据,我就需要先提取出一条数据来让她测试,简单用BufferedReader 来实现一个版本
  • 循环读取文件,每次读取完之后close,想着这样虽然慢一点,但是只读一条数据,应该还是可以的。

结果

  • 跑起来之后三分钟只读取了6条,太慢了
  • cpu 60%, 内存 80%,磁盘100%(瓶颈在磁盘)
  • 马上准备改用MappedByteBuffer来读取

内存映射文件

  • 内存映射文件与虚拟内存有些类似,通过内存映射文件可以保留一个地址空间的区域,同时将物理存储器提交给此区域,内存文件映射的物理存储器来自一个已经存在于磁盘上的文件,而且在对该文件进行操作之前必须首先对文件进行映射。使用内存映射文件处理存储于磁盘上的文件时,将不必再对文件执行I/O操作,使得内存映射文件在处理大数据量的文件时能起到相当重要的作用。
  • 文件有很多,并且每个都很大,现在我的内存是固定的且和文件比是很小的。内存映射文件也就是,先把文件地址先读取到内存,然后这个就直接映射成整个文件。也就是当我新建了一个MappedByteBuffer[]数组,每个对象映射到每个文件,就相当于我现在把所有的文件都加载到了内存
  • 读取的时候当一部分内容已经加载进内存了,就直接从内存读取,当读取的指针发现数据在内存中没有加载的时候,就会触发去磁盘读取这部分数据,加载到内存,之前已经加载的内存数据就作废处理。这样相当于我们已经在内存里加载了全部的数据
private void map() throws Exception {
        for (int i = 1; i <= 256; i++) {
            File channel = new File( i + " ChannelMatricesPerRay.txt");
            FileInputStream channelInputStream = new FileInputStream(channel);
            channelMappedBuffer[i - 1] = channelInputStream.getChannel().map(FileChannel.MapMode.READ_ONLY, 0, channel.length());
            File delay = new File( i + " Rays.txt");
            FileInputStream delayInputStream = new FileInputStream(delay);
            delayMappedBuffer[i - 1] = delayInputStream.getChannel().map(FileChannel.MapMode.READ_ONLY, 0, delay.length());
        }
    }

按行读取数据

private String getNextLine(String fileType, Integer fileNumber) {
        byte aByte = new Byte("0");
        List<Byte> bytes= new ArrayList<>();
        // byte == 10 的话就是 \n
        while(aByte != 10) {
            if("channel".equals(fileType)) {
                aByte = channelMappedBuffer[fileNumber].get();
            }else {
                aByte = delayMappedBuffer[fileNumber].get();
            }
            bytes.add(aByte);
        }
        byte[] resultBytes = new byte[chars.size()];
        for (int j = 0; j < chars.size(); j++) {
            resultBytes [j] = chars.get(j);
        }
        return new String(resultBytes);
    }

现象

  • cpu 80%, 磁盘 80%, 内存90%
  • 当生成 5000 个文件之后,速度明显下降,生成1000文件花销时间是5000的两到三倍

开始以为是程序写炸了,观察监控,发现在写入5000个文件之后突然磁盘上升到100%,开启debug模式再次重跑,一样的问题,开始调试业务代码,发现没有错误。再次观察监控,发现磁盘又降下去了,这时候就明白了。应该是一开始加载到内存的数据差不多读完了,开始从磁盘读取下一份数据。然后机械硬盘读取速度又很慢,所以导致看到的现象是卡住了一样。

改变

性能瓶颈是磁盘读取原数据速度,这边直接将原始文件拷贝至C盘(固态硬盘),这时候读写速度应该就解决了,果不其然,当源文件和写出的文件全部放到固态硬盘之后,磁盘最高也就50%,读取数据100M/S,写入速度也上升了一个档次30M/S,最后这个任务被完美解决了。

总结

  • 这次学习到了内存映射(MappedByteBuffer)的用法和对它有一点认知。
  • 还是有需要改进的地方,这次所有的代码都是用单线程的,可以在改进成每条数据处理和写出作为一个任务,开多线程去跑,让磁盘写出不成为瓶颈
  • 不支持断点续跑的功能,这个还需要想一下怎么实现
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