学习小组Day3----七七七七
学习内容：
- conda：linux的应用商店（精华版：miniconda）
- 安装和配置miniconda
- 使用miniconda
一、安装相当于App store 的miniconda
百度搜索 miniconda 清华 点击第一个链接进入清华镜像
下拉找到这个网站
屏幕快照 2020-04-19 上午10.52.02.png
点进去，找到Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh这个最新版本，并且是适用于服务器的86_64位数的安装包（注：连接服务器，输入命令uname -a，查看服务器位数）
右键单击，拷贝链接
屏幕快照 2020-04-19 上午10.55.33.png
安装软件的命令：
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
这一步只是导入了一个.sh的脚本，接下来进行安装
输入命令：
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
回车跳过一切版权信息，输入yes或者点击enter
屏幕快照 2020-04-19 上午11.05.43.png
出现thank you for 的字样安装成功
输入命令：
source ~/.bashrc
来激活conda
激活后输入命令：
conda
启动conda软件
二、运用miniconda
conda list#查看当前所有软件列表#
conda search fastqc#搜索fastqc软件#
conda install fastqc -y#默认安装最新版本，-y自动安装的命令#
conda install fastqc=0.11.7 -y#安装指定版本#
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fastqc安装完成
下面学习卸载fastqc
conda remove fastqc -y
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选修：conda环境
1、查看conda环境
conda info --envs#带*的就是默认环境#
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2、创立一个conda环境
创建新的环境，命名rna-seq，指定python版本3，同时安装fastqc trimmomatic软件,输入命令一步到位：
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
再次conda info --envs检查环境
屏幕快照 2020-04-19 下午1.52.49.png
这次有两个环境，一个名为base的和一个名为rna-seq的，默认还是*base的环境。
新的环境需要激活
3、激活新的环境
conda activate rna-seq
命令让*转移到rna-seq环境的前面，变成默认环境
fastqc
查看这个软件（没有任何命令，只代表你成功安装并且能够使用）
4、思维导图
屏幕快照 2020-04-19 下午2.06.18.png
