硝化细菌是1889年由维诺格拉得斯基第一次分离出来的化能自养菌，包括亚硝化菌属和硝化杆菌属两个生理亚群，它们归属于一个独立的科——硝化杆菌科。但从进化谱系上看，它们之间的亲缘关系并不密切。硝化杆菌科包括9个属，它们分别是：硝化杆菌属、硝化刺菌属、硝化球菌属、硝化螺菌属、亚硝化单胞菌属、亚硝化螺菌属、亚硝化球菌属、亚硝化叶菌属、亚硝化弧菌属。
目前市售硝化细菌菌剂种类繁多，硝化作用效果参差不齐，无论固体还是液体硝化菌，大多数为生物直投法使用。硝化细菌菌剂的净化效果除了受生长环境的影响，主要受菌剂本身特性的影响。就处理效果而言，市场上液体硝化菌效果明显优于固体硝化菌。
尽管进口复合菌剂有较好的效果，但在工业应用中不具有针对性，且需要定期添加菌剂维持。其出售菌剂都是按照固定的细菌类别配比制备而成。但是处理不同的污水，由于水质原因和生长条件的不同，复合菌剂中的某些成分，不但不能在该条件下生长繁殖，还可能短时间内衰亡，在污水处理中不起任何作用。故复合菌剂在实际应用中，菌剂部分成分为无效组分，在一定程度上是一种资源浪费。
硝化细菌是一种安全性较高的菌剂。硝化菌在污水处理中的应用需要更深层次的研究，以获得更高效的工程应用效果。利于扩大培养、硝化作用活性更强、适应能力较好的硝化细菌菌剂。
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