1GEO
image.png
image.png
image.png
直接发邮件要数据
image.png
10×数据提取3个文件或者一个表达矩阵
image.png
2EBI
image.png
image.png
image.png
image.png
点download
image.png
可以参考相同研究的marker基因用来注释;
一般下载raw数据,不要标准化的数据
3胖老大宝数据库
image.png
image.png
protocal筛选测序方法,点样本旁边的view,可以直接下载R.data
基因检索功能
image.png
image.png
image.png
marker基因检索功能
image.png
文献知识库
image.png
胖老大宝总结
image.png
4HCA用来找对照样本
image.png
5scRNASeqDB
image.png
检索基因在不同细胞中的表达水平
image.png
检索细胞
image.png
6BIsc
image.png
7cellmarker数据库用来注释细胞
image.png
image.png
数据库总结
image.png
数据检索:HCA用来找对照,scRNAseqDB可以检索细胞类型
数据分析:panglaoDB有分析最新分析方法的文献
研究基础:看别人是怎么设计课题,panglaoDB可以检索单基因,Broad institute有很多新研究的数据
细胞注释:首选cellmarker,HCL是一个比较新的marker数据库
其他
image.png
image.png