bed文件操作

1.bed 排序

第1列按照染色体编号进行排序，排序后应该是chr1, chr2, chr4, chr5, chr10, chr20, chrX. 使用-V
第2列和第3列按照数字序进行排序。使用-n

sort -t $'\t'  -k1,1V -k2,2n -k3,3n  bed > sort.bed

其中-k选项是指定第几列

最后编辑于：2021.12.09 11:05:26

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