在生物信息学中，linux系统伸手大家喜欢，整理了一下相关的操作命令(包括命令+选项+参数），以供参考。
1.touch(创建一个空白文件或者更新已有的文件，还可以用来更新文件的时间）
for example:touch abc.txt (注释：touch .abc.txt 建立隐藏文件)
2.ls(浏览当期目录的内容)
参数 -a 显示所有文件，包括隐藏文件、-l显示文件信息，包括时间，文件大小等
3.cd(进入某一目录)
such as：cd /home/user/python
cd.. 进入上一级目录
4.pwd(查看目录所在的位置)
5.mkdir(新建一个目录，mkdirs可用来递归建立目录）
6.cat(查看文件内容)
7.less(查看比较大的文件)
8.cp(复制文件)
9.mv(移动文件)
for example：mv /home/user/python /home/user/ok
10.rm(删除文件)
11.vi(文件编辑工具 :命令行模式 wq保存退出 q!强制退出不保存)
12.chomd(修改文件权限，其中文件权限可分为rwx)
13.head(查看文件前几行)
14.tail(查看文件的后几行)
15.grep(文本搜索命令)
such as grep -i(忽略字符大小）-v(显示不包含文本的行) “搜索条件” file
16.wc(统计并输出文件的字节数，字数行为 -c字节数 -w单字数 -l行数)
17.sort(文件排序)
18.管道|(前一个文本输出——>后一个输入)
19.重定向>
20.man(查看指定的使用方法)
21.find(指定目录下查找文件)
22.作业管理(&后台符 kill终止指定进程 ps查看任务运行情况)
另外介绍序列比对的工具：
1.建库
make blastdb -in file -dbtype nucl/prot -title -
2.比对
blastall -i file -d file -p blastn -e 10(exp) -b5 -v5
