R语言绘图之heatmap

今天来学习一下基于R语言的热图基本绘制方式,首先要明白热图在说明一个什么问题,举个栗子比如下面这张热图:

这张图首先看图例,那个Type,蓝绿色代表的是对照组(自然组),粉红色代表的是实验组(处理组),Type左边的由红到蓝的渐变条带代表的是表达丰度梯度,图片最上方的一行type也代表的是实验组和对照组的分类,代表左边的6列是对照组,右边的6列是实验组,组名就是下面的GSM开头的一串数字,右边的许多字母代表的是基因名,所以我们绘制热图需要的信息就是两个东西:一个是表达矩阵文件,一个是分组文件,即:
表达矩阵
分组信息
准备好这两个文件之后,下面交给R
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