R语言绘图之heatmap

今天来学习一下基于R语言的热图基本绘制方式，首先要明白热图在说明一个什么问题，举个栗子比如下面这张热图：

这张图首先看图例，那个Type，蓝绿色代表的是对照组（自然组），粉红色代表的是实验组（处理组），Type左边的由红到蓝的渐变条带代表的是表达丰度梯度，图片最上方的一行type也代表的是实验组和对照组的分类，代表左边的6列是对照组，右边的6列是实验组，组名就是下面的GSM开头的一串数字，右边的许多字母代表的是基因名，所以我们绘制热图需要的信息就是两个东西：一个是表达矩阵文件，一个是分组文件，即：

表达矩阵

分组信息

准备好这两个文件之后，下面交给R

image.png

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