肝与肾的关系主要表现在精血同源、藏泄互用及阴阳承制等方面。
在精血同源方面，肾精的充盛，有赖于肝血的滋养；肝血的充盈，有赖于肾精的化生。精与血之间可以相互滋生和转化，故有“肝肾同源”、“精血同源”或“乙癸同源”之说。
在藏泄互用方面，肝气疏泄，可使肾之开合有度；肾之封藏则可制约肝之疏泄太过。封藏与疏泄，相互为用，相互制约，共同调节女子月经来潮、排卵和男子泄精功能。
在阴阳承制方面，由于肝肾同源，肝肾的阴阳之间又息息相通，相互制约，相互滋生。肾阴充盛则能滋养肝阴，并制约肝阳不致偏亢；肝阴充足，疏泄功能正常，则能促进肾阴充盛。
在病理情况下，肝血不足与肾精亏虚多相互影响，从而出现头昏目眩、耳鸣耳聋、腰膝痠软等肝肾精血两亏等证；
若肝肾藏泄互用失常，女子可见月经周期紊乱、经量过多或闭经，
男子可见遗精、滑泄，或阳强不泄等症；若肾阴不足，可致肝阴不足，而肝阴不足，日久也可损及肾阴，最终导致肝肾阴虚，肝阳上亢之证，表现为头晕目眩、面红目赤、急躁易怒、失眠、烦热盗汗、耳鸣、腰膝痠软，或梦遗滑精等症，称为“水不涵木”。
