作者，Evil Genius
时间飞快。
首先我们来看一下什么是repeat RNAs（重复RNAs）。
repeat RNAs是一类特殊的非编码RNA，它们与DNA复制叉相关，并在复制后DNA修复过程中发挥作用。这类RNA在真核生物中广泛存在，并且与多种生物学过程密切相关。
具体来说，repeat RNAs通过与复制叉相互作用，影响DNA复制的效率和准确性。此外，它们还在DNA损伤修复过程中发挥调控作用，帮助细胞修复复制过程中产生的错误，从而维持基因组的稳定性
什么又是复制叉呢？
复制叉是DNA复制时在DNA链上形成的Y字型结构，也称为复制叉或生长点。 复制叉的形成涉及解旋、解链和SSB蛋白的结合等过程，是DNA复制的关键部位。
在DNA复制过程中，复制叉沿着亲代DNA链移动，导致亲代双链的连续变性及子代双螺旋的重新形成。复制叉从位于复制起始点的起点开始移动，可以是单向复制或双向复制，取决于起始点的设置。复制叉是复制有关的酶和蛋白质组装成复合物和新链合成的部位。
今日参考文献
人类胰腺癌的单分子空间成像鉴定了癌细胞中重复RNA的异常表达，以及与干扰素对重复元件病毒样行为的反应诱导的细胞命运改变相关的肿瘤周围微环境。
- 最近的研究揭示了PDAC细胞和癌症相关成纤维细胞（CAFs）的单细胞异质性，它们构成了大部分肿瘤微环境（TME）。
- 不同的重复RNA亚类表达模式与不同的肿瘤细胞内在状态和免疫微环境相关。
- 肿瘤细胞驱动的内源性病毒样反应对癌细胞和胰腺癌微环境的单细胞异质性具有广泛的影响。
多种repeat RNAs在PDAC肿瘤细胞和周围微环境中的空间分解
NanoString CosMx spatial molecular imager (SMI) platform
- 从46例切除的人类PDAC原发肿瘤中收集了空间分辨的单细胞转录组数据。
-
空间转录组学技术在PDAC肿瘤细胞中发现了丰富的repeat RNAs表达，在不同微环境细胞类型中发现了较低但仍然异常的表达。
repeat RNAs表达与PDAC TME不同细胞类型的炎症反应和细胞状态变化相关
- 为了更好地了解肿瘤细胞中重复RNA表达与基因表达谱的关系，我们将肿瘤细胞在CosMx数据中分为高和低LINE-1 ORF1组。这些组之间的差异基因表达分析显示LINE-1与其他repeat RNAs共表达。
-
CAF从myCAF到iCAF表型的过渡状态。
含有repeat RNAs的EVs诱导PDAC和CAF细胞的细胞状态失调
EVs提供了在TME中不同细胞类型之间传递repeat RNA的载体，驱动PDAC-CAF细胞串扰，调节细胞可塑性和肿瘤内异质性。
不同的repeat RNAs种类可以驱动CAFs细胞的可塑性反应
- 病毒对CAFs中repeat RNAs的模仿反应。
- 为了研究重复RNA对CAF亚型的动态变化，对转染了IVT HSATII ssRNA的三种CAF细胞系进行了scRNA测序。
- 数据表明，在单细胞空间转录组学中观察到，repeat RNA species之间CAF细胞状态从myCAF到iCAF的共同改变。
-
repeat RNAs足以改变CAF细胞身份，并提供细胞外部信号，促进PDAC EMT。
Repeat RNA species诱导PDAC细胞EMT可塑性
-
HSATII Repeat RNA是PDAC EMT异质性的重要驱动因素。
PDAC和CAF细胞对具有共同IRF3依赖性的Repeat RNA 有反应
-
CAFs和PDAC之间对Repeat RNA的不同反应是由不同的IRF3依赖性转录特征驱动的，这有助于与Repeat RNA表达相关的细胞状态变化。
CAF和PDAC细胞具有不同的Repeat RNA感应机制
-
PDAC细胞通过与炎症反应和EMT基因表达相关的经典RNA sensors对Repeat RNA做出反应，而CAFs通过与MAVS相关的尚未确定的sensors做出反应.
