R——相关关系热图
> # 构建相关关系矩阵
> library(psych)
> data.corr <- corr.test(rows, cols, method="pearson", adjust="fdr")
> data.r <- data.corr$r # 相关系数
> data.p <- data.corr$p # p值
>
> # 画热图
> library(pheatmap)
> pheatmap(data.r, clustering_method="average")
R内置函数 cor() 可以用来计算相关系数:cor(x, method = c("pearson", "kendall", "spearman")),如果数据有缺失值,用cor(x, method = "pearson", use = "complete.obs")。