Kim JN, Kim Y, Jeong Y, et al (2015) Comparative genomics reveals the core and accessory genomes of streptomyces speciesj. J Microbiol Biotechnol 25:1599–1605. https://doi.org/10.4014/jmb.1504.04008
基因组序列有助于研究进化背景。利用泛基因组比较分析了17种链霉菌Streptomyces。34592个同源簇构成了这些链霉菌物种的泛基因组，包括2018个核心基因组【共有】、11743个非必需基因组【介于中间】和20831个独特基因组【独有】。与的相比，核心基因组聚合到的基因数量比之前报道的要少，为3096个基因家族。功能富集分析表明，参与转录的基因在链霉菌全基因组中最为丰富。最后，我们研究了sigma因子、霉硫醇（mycothiol）生物合成途径和次级代谢途径的核心基因；许多参与应激反应和形态分化的基因在链霉菌中普遍表达。核心基因组的阐明为理解链霉菌物种的功能进化提供了基础，并为构建工业菌株的目标选择提供了见解。
dispensable 非必需
converge 聚合
