步骤 一（自己先安装snpeff软件，这里不讲）

## 编辑config文件 到snpEff文件夹

echo "# my own genome, version xxxx（es2024，这个是我的版本）

es2024.genome : es2024

" >> snpEff.config

步骤 二  准备建库的数据文件   基因组fa 注释gtf

这里跟其他人分享的差不多，自己去查

步骤 三，建库

xxxxx@xxxxx:~/miniconda3/pkgs/snpeff-5.2-hdfd78af_1/share/snpeff-5.2-1$ java -jar snpEff.jar build -gtf22 -v es2024（数据文件没问题的前提，运行这个肯定或报错）

重新运行下面这个。这就解决了。

xxxxx@xxxxx:~/miniconda3/pkgs/snpeff-5.2-hdfd78af_1/share/snpeff-5.2-1$ java -jar snpEff.jar build -gtf22 -v es2024 -noCheckCds -noCheckProtein