windows下安装VituralBox以使用Linux系统分析数据

## 出发点

一直以来,别人找过来,说是要**讨论生物信息**、**讨论高通量测序**,很抱歉,我从一开始就会亮出底牌,**我是做生物的,不是做生信的**。

没错,我就是一个做生物的。既然是做生物的,我写了大多数东西的出发点就是,

`我们做湿实验的也看得懂,能重复,可以出没有原则性错误的结果`

既然如此,既然**改变不了搞生信的一班子,无法让他们写windows下能运行的东西,那么我们只能让步,搞搞一些linux**。想来想去,那就用最粗暴的方式,我们搞搞大家都能搞定的**虚拟机 -- VirtualBox**

## 目的

在windows下安装VirtualBox,

使用最友好最简单Linux运行班,Ubuntu

## 下载ubuntu系统安装文件

进入ubuntu官网,进入[下载页面](https://www.ubuntu.com/download/desktop),点击Download


跳转到新的页面,*如果你愿意的话,那么可以捐助*,一般直接点击“Not now...”,进入下载页面


一般这种情况会弹出下载对话框,可以下载`ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso`,如果没有,那么点击`download now`。并等待下载完成

于是我们得到了`ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso`这个文件,后面可以用于创建虚拟机。


## 下载与安装VirtualBox

进入VirtualBox官网,进入[下载页面](https://www.virtualbox.org/wiki/Downloads)

点击*Windows hosts*,下载对应VirtualBox安装包

下载结束之后,双击图标安装


一直**下一步**即可安装完成,

安装过程可能会影响当前机器的网络,应是在进行网络桥接

打开后界面如下

创建一个新的虚拟机,**进入专家模式**,调整对应的参数,我们至少要保留**4G**的内存,不然就很麻烦


点击创建,进入下一步,**有必要的话,我们自定义一个虚拟机文件放置位置**


确定位置之后,我们给**50Gb的硬盘空间**,同时设置为**固定大小**,**这样运行起来会很快**,*都要分析数据了,这点空间不算什么*



开始创建


创建好了之后是这样的


## 在VituralBox上安装Ubuntu系统

双击该虚拟机,会弹出**选择启动盘**


随后选择之前下载的`ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso`,并点击启动即可

### 注意

如果没有弹出这个选项,而是显示

那么可能是因为之前取消过,那么就点击`设备`,选择`分配光驱`,点击`选择虚拟盘`

此时在弹出电话框中,选择之前下载的 `ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso`


随后关闭关闭虚拟机,并双击重启即可进入Ubuntu安装界面

## 安装Ubuntu

接下来的步骤,**基本全部直接点击下一步即可**

在时间区域,或许可以直接选择上海


选择键盘

设置一些有的没的信息


然后就开始安装

过程还是比较顺畅,没有发现什么问题

安装完成直接,会提示重启虚拟机的Ubuntu系统,进入之后可能看到提示,大概意思是,**请移除系统安装介质**的英文,那是因为刚才的光盘没有弹出,可能可以做以下操作


随后重启虚拟机即可

OK,就这样,安装完成

## 一些可选设置(可选),可以提高运行性能

默认会开启的虚拟化参数

启动3D加速,如此图形化界面不会卡顿

重新开启Ubuntu,输入密码,进入Ubuntu

点击`安装增强功能`,

随后在Ubuntu里面会出现安装弹窗,选择`Run`


等待安装完毕即可

**如果失败**,如下

那么这个时间就回车

尝试更新一下系统,是否能行

在桌面上,鼠标邮件,重新打开命令行,

输入`sudo apt-get update`,随后输入密码,回车


类似的,输入`sudo apt-get upgrade`


输入Y就可以了,等着升级完成



如果直接重新点击安装增强功能,应该会失败

那么可以弹出光盘尝试

结果还是一样,考虑到提示,意思就是`Until the system restart`,那么就重新关闭这个虚拟机,重启一次Ubuntu即可

同样,输入登录密码,进入系统,重新选择**安装增强功能**

从上图的提示可以看到,我们已经成功了

## 设置共享文件夹

毕竟我们是在windows下面操作的比较多,**如何将windows下的文件,直接在虚拟机的Linux下使用**,这个应是会直接影响我们的工作,所以需要设置一下共享文件夹

如此,先在windows下,创建一个目录


随后回到虚拟机的Ubuntu窗口,点击**共享文件夹** (PS: *顺便共享剪切板,双向*)

设置好选项


随后在弹出的对话框中选择刚才我们创建的文件夹



点击OK,确定添加,并点击OK,即可

随后在桌面,鼠标邮件,打开Terminal

依次输入以下命令

```bash

ls

cd Desktop

mkdir share

sudo mount -t vboxsf share share

```

分别是列出当前目录内容,进入Desktop这个文件夹,创建一个文件夹叫做share,挂载共享目录

挂载完成,以后,凡是在share目录下的文件,无论是windows下,还是Linux下,都可以直接看到



似乎保存不了,于是我直接重新在linux下创建了一个new.txt

随后黏贴文本,保存,直接在windows下打开

没问题。

### 设置开机自动挂载

以上操作,虚拟机重启之后,就会消失,所以我们需要设置下虚拟机中Ubuntu的开机自动挂载共享目录

切换到root用户,并编辑类似**windows开机启动项**的文件 rc.local

```

sudo -s 

nano /etc/rc.local

```

在`exit 0` 的上一行添加以下命令,即为共享目录挂载命令

```

sudo mount -t vboxsf share /home/tbtools/Desktop/share

```

ctrl+X,随后摁键盘Y,表示确认保存


## 推送结束

嗯....这只是一个铺垫,

虽然我们要尽可能避免使用linux,但是很多时候还是没有办法

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