参考://www.greatytc.com/p/56c7101bea2d
原作者:Peng_001
前言:本数据库的收集主要参考了Peng_001的文章,在此基础上只保留了非肿瘤专业的网络药理学数据库。以后会在学习基础上随时更新。
疾病数据库
OMIM数据库http://www.omim.org/
PharmGkb 数据库http://www.pharmgkb.org/
GAD数据库http://geneticassociationdb.nih.gov/
TTD 数据库http://db.idrblab.org/ttd/
化学结构数据库
Pubchem数据库https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
chemspider 数据库http://www.chemspider.com/
天然药物数据库
TCMSP数据库http://5th.tcmspw.com/tcmsp.php
上海有机所的中药与化学成分数据库http://www.chemcpd.csdb.cn/scdb/main/tcm_introduce.asp
TCMID数据库http://119.3.41.228:8000/tcmid/search/
BATMAN-TCM数据库http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/
蛋白分子数据库
Uniprot数据库https://www.uniprot.org/
PDB数据库 https://www.rcsb.org/#Category-search
蛋白互作数据库
STRING数据库https://string-db.org/
BioGRID数据库https://thebiogrid.org/
基因互作预测数据库
GeneMANIA数据库http://www.genemania.org
化学药物与蛋白互作数据库
STITCH databasehttp://stitch.embl.de/
Comparative Toxicogenomics Databasehttp://ctdbase.org/
功能富集分析数据库
Davidhttps://david.ncifcrf.gov/
WebGestalthttp://www.webgestalt.org/
高通量分析数据库
GEO 数据库https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/
TCGA数据库http://www.tcga.org/
分子对接数据库
systemsDOCKhttp://systemsdock.unit.oist.jp/iddp/home/index
CPI-BIOhttp://cpi.bio-x.cn/drar/
PharmMapperhttps://omictools.com/pharmmapper-tool
其他
软件:cytospace
编程语言:R、python