1、特征工程是什么
有这么一句话在业界广泛流传:数据和特征决定了机器学习的上限,而模型和算法只是逼近这个上限而已。那特征工程到底是什么呢?顾名思义,其本质是一项工程活动,目的是最大限度地从原始数据中提取特征以供算法和模型使用。通过总结和归纳,目前认为特征工程包括以下方面:
特征处理是特征工程的核心部分,sklearn提供了较为完整的特征处理方法,包括数据预处理、特征选择、降维等。
本文中使用sklearn中的IRIS(鸢尾花)数据集来对特征处理功能进行说明。IRIS数据集由Fisher在1936年整理,包含4个特征(Sepal.Length(花萼长度)、Sepal.Width(花萼宽度)、Petal.Length(花瓣长度)、Petal.Width(花瓣宽度)),特征值都为正浮点数,单位为厘米。目标值为鸢尾花的分类(Iris Setosa(山鸢尾)、Iris Versicolour(杂色鸢尾),Iris Virginica(维吉尼亚鸢尾))。导入IRIS数据集的代码如下:
from sklearn.datasets import load_iris
# 导入IRIS数据集
iris = load_iris()
# 特征矩阵
iris.data
# 目标向量
iris.target
2、数据预处理
通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征有可能有以下问题:
- 不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较;
- 定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征:假设有N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码的特征可达到非线性的效果;
- 存在缺失值:缺失值需要补充;
- 信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。
使用sklearn中是的preprocessing库来进行数据预处理,可以覆盖以上问题的解决方案。
2.1 无量纲化
无量纲化使不同规格的数据转换到同一规格。常用的无量纲化方法有标准化和区间缩放法。标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布;区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0,1]等。
2.1.1 标准化
标准化需要计算特征的均值和标准差,公式表达为:
使用preprocessing的StandardScaler类对数据进行标准化的代码如下:
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 标准化,返回值为标准化后的数据
StandardScaler().fit_transform(iris.data)
2.1.2 区间缩放法
区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,公式表达为:
使用preprocessing库的MinMaxScaler类对数据进行区间缩放的代码如下:
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
# 区间缩放,返回值缩放到[0,1]区间的数据
MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)
2.1.3 标准化与归一化的区别
简单来说,标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下;归一化是依照特征矩阵的行处理数据,其目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准,也就是说都转化为“单位向量”。规则为l2的归一化公式如下:
使用preprocessing库的Normalizer类对数据进行归一化的代码如下:
from sklearn.preprocessing import Normalizer
# 归一化,返回值为归一化后的数据
Normalizer().fit_transform(iris.data)
2.2 对定量特征二值化
定量特征的二值化的核心在于设定一个阈值,小于等于阈值的赋值为0,大于阈值的赋值为1,公式表达如下:
使用preprocessing库的Binarizer类对数据进行二值化的代码如下:
from sklearn.preprocessing import Binarizer
# 二值化,阈值为3,返回值为二值化后的数据
Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)
2.3 对定性特征哑编码
由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行哑编码(实际上是不需要的)。
使用preprocessing库的OneHotEncoder类对数据进行哑编码的代码如下:
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
# 哑编码,对IRIS数据集的目标值,返回哑编码后的数据
OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape((-1,1)))
2.4 缺失值计算
由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。
使用preprocessing库的Imputer类对数据进行缺失值计算的代码如下:
from numpy import vstack,array,nan
from sklearn.preprocessing import Imputer
# 缺失值计算,返回值为结算缺失值后的数据
# 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN
# 参数strategy为默认填充方式,默认为mean(均值)
Imputer().fit_transform(vstack((array([nan,nan,nan,nan]),iris.data)))
2.5 数据变换
常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。4个特征,度为2的多项式转换公式如下:
使用preprocessing库的PolynomialFeatures类对数据多项式转化的代码如下:
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
# 多项式转换
# 参数degree为度
PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)
基于单变元函数的数据变换可以使用一个同一的方式完成,使用preprocessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换的代码如下:
from numpy import log1p
from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer
# 自定义转换函数为对数函数的数据变换
# 第一个参数是单变元函数
FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)
3、特征选择
当数据预处理完成后,我们需要选择有意义的特征输入机器学习的算法和模型进行训练。通常来说,从两个方面考虑来选择特征:
- 特征是否发散:如果一个特征不发散,例如方差接近于0,也就是说样本在这个特征上基本上没有差异,这个特征对于样本的区分并没有什么用;
- 特征与目标的相关性:这点比较显见,与目标相关性高的特征应当优先选择。
根据特征选择的形式又可以将特征选择方法分为3种: - Filter:过滤法,按照发散性或者相关性对各个特征进行评分,设定阈值或者选择阈值的个数,选择特征;
- Wrapper:包装法,根据目标函数(通常是预测效果评分),每次选择若干特征,或者排除若干特征;
- Embedded:嵌入法,先使用某些机器学习的算法和模型进行训练,得到各个特征的权值系数,根据系数从大到小选择特征。类似于Filter方法,但是通过训练来确定特征的优劣。
我们使用sklearn中的feature_selection库来进行特征选择。
3.1 Filter
3.1.1 方差选择法
使用方差选择法,先要计算各个特征的方差,选择方差大于阈值的特征。
使用feature_selection库的VarianceThreshold类来选择特征的代码如下:
from sklearn.feature_selection import VarianceThreshold
# 方差选择法,返回值为特征选择后的数据
# 参数threshold为方差的阈值
VarianceThreshold(threshold=3).fit_transform(iris.data)
3.1.2 相关系数法
使用相关系数法,先要计算各个特征对目标值的相关系数的P值。用feature_selection库的SelectKBest类结合相关系数来选择特征的代码如下:
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from scipy.stats import pearsonr
#选择K个最好的特征,返回选择特征后的数据
#第一个参数为计算评估特征是否好的函数,该函数输入特征矩阵和目标向量,输出二元组(评分,P值)的数组,数组第i项为第i个特征的评分和P值。在此定义为计算相关系数
#参数k为选择的特征个数
SelectKBest(lambda X, Y: array(map(lambda x:pearsonr(x, Y), X.T)).T, k=2).fit_transform(iris.data, iris.target)
# 此处代码有问题,得改
3.1.3 卡方检验
经典的卡方检验是检验定性自变量对定性因变量的相关性。假设自变量有N种取值,因变量有M种取值,考虑自变量等于i且因变量等于j的样本频数的观察值与期望的差距,构建统计量:
使用feature_selection库的SelectionKBest类结合卡方检验来选择特征的代码如下:
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from sklearn.feature_selection import chi2
# 选择K个最好的特征,返回选择特征后的数据
SelectKBest(chi2,k=2).fit_transform(iris.data,iris.target)
3.1.4 互信息法
经典的互信息也是评价定性自变量对定性因变量的相关性的,互信息计算公式如下:
为了处理定量数据,最大信息系数法被提出,使用feature_selection库的SelectKBest类结合最大信息系数法来选择特征的代码如下:
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from minepy import MINE
# 由于MINE的设计不是函数式,定义mic方法将其改为函数式的,返回一个二元组,二元组的第2项设置成固定的P值0.5
def mic(x,y):
m = MINE()
m.compute_score(x,y)
return (m.mic(),0.5)
# 选择K个最好的特征,返回特征选择后的数据
SelectKBest(lambda X, Y: array(map(lambda x:mic(x, Y), X.T)).T, k=2).fit_transform(iris.data, iris.target)
# 此处代码有问题,得改
3.2 Wrapper
3.2.1 递归特征消除法
递归消除特征法使用一个基模型来进行多轮训练,每轮训练后,消除若干权值系数的特征,再基于新的特征集进行下一轮训练。
使用feature_selection库的RFE类来选择特征的代码如下:
from sklearn.feature_selection import RFE
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
# 递归特征消除法,返回特征选择后的数据
# 参数estimator为基模型
# 参数n_features_to_select为选择的特征个数
RFE(estimator=LogisticRegression(),n_features_to_select=2).fit_transform(iris.data,iris.target)
Embedded
3.3.1 基于惩罚项的特征选择法
使用带惩罚项的基模型,除了筛选出特征外,同时也进行了降维。
使用feature_selection库的SelectFromModel类结合带L1惩罚项的逻辑回归模型,来选择特征的代码如下:
from sklearn.feature_selection import RFE
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
# 递归特征消除法,返回特征选择后的数据
# 参数estimator为基模型
# 参数n_features_to_select为选择的特征个数
RFE(estimator=LogisticRegression(),n_features_to_select=2).fit_transform(iris.data,iris.target)
# 此处代码有问题
3.3.2 基于树模型的特征选择法
树模型中GBDT也可以用来作为基模型进行特征选择,用feature_selection库的SelectFromModel类结合GBDT模型,来选择特征的代码如下:
from sklearn.feature_selection import SelectFromModel
from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier
# GBDT作为基模型的特征选择
SelectFromModel(GradientBoostingClassifier()).fit_transform(iris.data,iris.target)
4、降维
当特征选择完成后,可以直接训练模型了,但是可能由于特征矩阵过大,导致计算量大、训练时间长的问题,因此降低特征矩阵维度也是必不可少的。常见的降维方法除了以上提到的基于L1惩罚项的模型以外,另外还有主成分分析法(PCA)和线性判别分析(LDA),线性判别分析本身也是一个分类模型。PCA和LDA有很多的相似点,其本质是要将原始的样本映射到维度更低的样本空间中,但是PCA和LDA的映射目标不一样:PCA是为了让映射后的样本具有最大的发散性;而LDA是为了让映射后的样本有最好的分类性能。所以说PCA是一种无监督的降维方法,而LDA是一种有监督的降维方法。
4.1 主成分分析法(PCA)
使用decomposition库的PCA类特征的代码如下:
from sklearn.decomposition import PCA
# 主成分分析法,返回降维后的数据
# 参数n_components为主成分数目
PCA(n_components=2).fit_transform(iris.data)
4.2 线性判别分析法(LDA)
使用lda库的LDA类选择特征的代码如下:
from sklearn.discriminant_analysis import LinearDiscriminantAnalysis as LDA
# 线性判别分析法,返回降维后的数据
# 参数n_components为降维后的维数
LDA(n_components=2).fit_transform(iris.data,iris.target)
本文摘自jasonfreak的博客