野藤老哥快两个月没更新了，说实话，我心里也不是很想继续更新了（生活杂事的除外），觉得一废时间，二没有意义。费时间体现在每天晚上我只有3-4个小时的个人时间，写个文章要花1-2个小时，个人生活时间被压缩了，如果我自己学习的话只需要自己做笔记就好了。
没有意义是觉得写到后面，感觉没有啥写的了（其实不是的），虽然说有些文章能帮到别人，但是持续力已经不足了，而且越来越背离了自己当初写文章的初心。生活上的烦恼、感情上的胡思乱想已经够糟心了，哎...
建议大家还是要理解我以前写的肿瘤评估的过程，要不然看起来很迷糊，最重要的还是要自己去做一个肿瘤项目。
PFS(Progression-free survival_无进展生存期)，定义为：从首次用药日期或者随机入组日期开始 到 首次发生疾病进展或死亡的时间（以先发生为准）。
选择首次给药日期还是随机入组日期，根据方案规定。我们下面的描述以首次给药日期作为PFS的起点。
通俗的讲，就是一个受试者入组开始吃药后（首次给药前要进行一系列的肿瘤评估测量，以确定基线，方便与给药后的肿瘤状态进行比较，从而得出总体评估结果），受试者在某个评估周期的总体评估结果是PD了，那么PFS记录的就是从首次给药到这次PD的这段时间。
PFS作为加速审批或者常规审批中的有效替代终点，通常用于随机研究，首选盲法。
优点是与生存研究相比所需要的病例少，所需的随访时间短；包括对疾病稳定的测定；不受交叉治疗和后续治疗的影响；通常基于客观定量的评价。
缺点就是非精确测量，受试者的评价存在偏倚，特别是在开放性研究中；在不同的研究中存在不同的定义；需要频繁的进行影像学评估和其他评估；需要平衡各个治疗组之间评估时间；并不一定与生存相关。
这里需要补充一点，虽然说PFS不受后续治疗的影响，我不确定它这里说的是不是新的抗肿瘤治疗，在实际做项目中，我们经常使用confirmed BOR去生成ADTTE数据集，比如DOR的衍生；
PFS用的也是confirmed之后的Overall Response去衍生（我们可以在创建ADRS的时候就对confirmed之后的Overall Response标上Y，这样在写ADTTE的时候就可以直接筛选），虽然说PD不需要确认，但是对于新的抗肿瘤治疗之后发生的PD，这时候的PD我们是不用于衍生PFS的，如果受试者在接受新的抗肿瘤治疗之后才发生PD，我们可以认为受试者在接受新的抗肿瘤治疗之前都没有发生疾病进展或者死亡，所以我们一般就会删失到接受其他新的抗肿瘤治疗前的末次影像学检查日期。
介绍了上面的一些概念，接下来我们就需要了解一下ADTTE数据集，用来专门存放至事件时间的数据，具体变量可以参考官网上的文档《adam_tte_final_v1》，以前写过了一下，那时候我好像还没写过ADTTE。
162:肿瘤终点之总生存期--Overall Survival
在ADTTE中，我觉得关键的几个变量就是
PARAM/PARAMCD/AVAL/STARTDT/ADT/CNSR/EVNTDESC/CNSDTDSC
①：在写ADTTE的时候，可能经常要区分研究者或者IRC的数据，这时候你就可以直接在PARAM进行区分，比如“无进展生存期-研究者”；“无进展生存期-IRC”；对应的PARAMCD就可以用“PFSINV”,"PFSIRC"。
②：STARTDT，至事件时间的开始日期，需要根据定义确定你的STARTDT，在PFS中就是首次给药日期。
③：CNSR/EVNTDESC/CNSDTDSC
需要注意的是，在IG中有明确说明CNSR这个变量的值用0代表事件，用>0代表删失。虽然CNSR在ig上的core是一个Cond变量，但是在至事件研究数据集却是一个Require的变量！
对于PFS来说，什么是事件？发生疾病进展或者死亡就是事件。其他情况就是删失，删失这个概念从字面来说确实不太好理解，算是生存分析中一个特别的概念吧。可以理解为EOI（Event of Interest）没有发生吧。下面是IG上的描述：
The distinguishing feature of survival data is that at the end of the observation period, the event of interest may not have occurred for all subjects. For these subjects, the only information available is that the event did not occur within the duration of study. Therefore, the time to event for these subjects is said to be censored (i.e., right-censored).
至于判断这个受试者是发生了事件还是删失，方案和SAP会有明确的规定，一般来说，会有下面这样类型的表格，几乎是所有实体瘤通用的事件/删失规则，但是在实际做项目的过程中，还是会出现不在下面列表的情况，这时候最好去向统计师确认判断规则（遗憾的是，有些统计师可能都不是很熟悉）。
我就根据上面的几条判定标准，一条条讲讲自己的看法和实现步骤。
在衍生PFS的时候，需要用的数据集可能有以下数据集：
ADSL-ADRS-TR-RS-DS等
ADSL需要用到新的抗肿瘤治疗变量，如何衍生看下面：
218:BOR(Best Overall Response) & ORR(客观缓解率)的相关知识点
ADRS需要用到confirmed之后的Overall Response。
TR需要用到各个访视的scan date
DS需要用到研究结束或者治疗结束的状态信息。
Rule1: 基线评估缺失
这个情况算是PFS特有的一个情况，需要注意的是，这个基线评估不是说缺少基线的总体评估结果（Overall Response），而且也不可能，你没有检测过，怎么比较得出总体评估结果呢（除非允许拿以前的检测结果）。
所以我们需要通过数据集TR判定受试者在基线的时候是否有肿瘤测量的记录，同时还需要注意的是如果有区分研究者评估或者IRC评估，那么需要加上评估者来判断是否有基线评估，然后分别去衍生param。
如果受试者基线评估缺失，也没有发生疾病进展或者死亡，那么受试者对应就是删失，然后ADT的值按照列表的规则就是删失到首次给药日期，即是ADT这个变量的值是首次给药日期，这时候我们就可以得到AVAL的值。
AVAL(月)=(ADT-STARTDT+1)/30.4375，如果四舍五入的话，一般都是0.
这时候在ADTTE中CNSR变量的值就是1；
EVNTDESC这个变量代表的意思是“事件或者删失描述”，因此EVNTDESC的值就是“基线评估缺失”。
CNSDTDSC这个变量代表的意思是删失日期描述，也就是描述如果这个受试者是删失的话，那么他的日期对应的描述是什么？也就是你用什么日期去作为他删失的日期，根据列表的规则，这种情况下CNSDTDSC的值就是“首次给药日期”。
如果受试者发生了事件，注意这时候CNSDTDSC是为空的，不要搞错了。不仅需要了解肿瘤评估的流程，各个变量代表的意思也要了解。
最终输出的数据集大概就是这样：
在写ADTTE的时候，可以看做各个数据集之间的merge，把需要的数据集处理之后，merge在一起，然后按照列表的规则一个一个进行判断，有点像我当初帮DM写SDV的情况，就是一大堆逻辑，先满足这个，再写那个，有点繁琐，也需要认真和耐心。
今天讲的这些东西很多都是面试题有可能会问的，后面的文章如果我加粗标了颜色的，都有可能代表是面试题。
