上次简单介绍了kNN算法,简单来说,通过计算目标值与样本数据的距离,选取k个最近的值,用出现概率大的分类值代表目标值的分类,算法实现比较简单,属于监督学习方法。
这篇文章打算简单介绍k-means聚类算法,与之前不同,是一种非监督的学习方法。
机器学习中两类大问题,分类和聚类。
分类是根据一些给定的已知类别标号的样本,训练某种学习机器,使它能够对未知类别的样本进行分类。这属于supervised learning(监督学习)。而聚类指事先并不知道任何样本的类别标号,希望通过某种算法来把一组未知类别的样本划分成若干类别,这在机器学习中被称作 unsupervised learning (无监督学习)。
k-means 聚类算法
通常,根据样本间的某种距离或者相似性来将样本分为不同类别,成为聚类。
比如给定数据集,部分数据(二维, 共80个)如下:
1.658985 4.285136
-3.453687 3.424321
4.838138 -1.151539
-5.379713 -3.362104
0.972564 2.924086
其可视化如下:
。
从分布状态,可以大概知道可以聚为4个cluster。最后目的是将4个不同的cluster标上不同的颜色。
利用k-means算法如下实现:
- 随机选取k个点作为初始质心。
- 对于样本中每一个点,分别求与k点的距离。距离最小者就属于该类。
- 此时对得到的k各类,重新计算新的质心。
- 当3步得到的质心与之前的质心误差很小时,分类结束。
其中用到的公式都特别简单,后面代码有详细叙述。
python 代码实现
# 数据初始化
import numpy as np
import random
import re
import matplotlib.pyplot as plt
def loadDataSet():
dataSet = np.loadtxt("dataSet.csv")
return dataSet
def initCentroids(dataSet, k):
# 从数据集中随机选取k个数据返回
dataSet = list(dataSet)
return random.sample(dataSet, k)
对应第2步,计算距离并分类,根据到不同质心的最短距离分类,用字典保存。
def minDistance(dataSet, centroidList):
# 对每个属于dataSet的item, 计算item与centroidList中k个质心的距离,找出距离最小的,并将item加入相应的簇类中
clusterDict = dict() #dict保存簇类结果
k = len(centroidList)
for item in dataSet:
vec1 = item
flag = -1
minDis = float("inf") # 初始化为最大值
for i in range(k):
vec2 = centroidList[i]
distance = calcuDistance(vec1, vec2) # error
if distance < minDis:
minDis = distance
flag = i # 循环结束时, flag保存与当前item最近的蔟标记
if flag not in clusterDict.keys():
clusterDict.setdefault(flag, [])
clusterDict[flag].append(item) #加入相应的类别中
return clusterDict #不同的类别
def getCentroids(clusterDict):
#重新计算k个质心
centroidList = []
for key in clusterDict.keys():
centroid = np.mean(clusterDict[key], axis=0)
centroidList.append(centroid)
return centroidList #得到新的质心
计算计算各蔟集合间的均方误差,来衡量聚类的效果
def getVar(centroidList, clusterDict):
# 计算各蔟集合间的均方误差
# 将蔟类中各个向量与质心的距离累加求和
sum = 0.0
for key in clusterDict.keys():
vec1 = centroidList[key]
distance = 0.0
for item in clusterDict[key]:
vec2 = item
distance += calcuDistance(vec1, vec2)
sum += distance
return sum
#测试聚类效果,并可视化
def test_k_means():
dataSet = loadDataSet()
centroidList = initCentroids(dataSet, 4)
clusterDict = minDistance(dataSet, centroidList)
# # getCentroids(clusterDict)
# showCluster(centroidList, clusterDict)
newVar = getVar(centroidList, clusterDict)
oldVar = 1 # 当两次聚类的误差小于某个值是,说明质心基本确定。
times = 2
while abs(newVar - oldVar) >= 0.00001:
centroidList = getCentroids(clusterDict)
clusterDict = minDistance(dataSet, centroidList)
oldVar = newVar
newVar = getVar(centroidList, clusterDict)
times += 1
showCluster(centroidList, clusterDict)
if __name__ == '__main__':
# show_fig()
test_k_means()
如上如,当两次计算质心之间的误差在0.00001之内时,可以认为聚类完成。
运行函数:
从结果可以看出,对着不断的迭代,聚类的效果越来越好,直至小于误差,完成聚类。
完成代码和数据请参考github:
github:k-means
总结
- 无监督学习
- k-means算法
- 最小化平方差刻画蔟内向量的紧密程度。
参考资料:(内有公式介绍)
聚类之均值聚类(k-means)算法的python实现
机器学习算法与Python实践之(五)k均值聚类(k-means)