汉献帝刘协是董卓扶植上位的，但由于董卓的残暴专政，和董卓之间的矛盾，也就成为汉献帝早年面临的最重要的矛盾。
公元190年的夏历三月，汉献帝被迫迁都到长安，但当时董卓还在洛阳收尾，要到第二年四月才到达长安。
这一年多一点的空档期，成为汉献帝暂时摆脱董卓的“亲密接触”的时机。年仅十岁的汉献帝，虽然没有能力独当一面，但也有了可依托的对象王允。
在董卓到达长安之前，王允主持朝政。史书上介绍王允说，这个人表面上对董卓虚与委蛇，假意奉承，以取得董卓的信任，而事实上忠于汉室，心里面在替汉献帝盘算。
当时汉献帝和其他朝廷大臣们都很倚重王允。
后来王允设计除掉了董卓，但朝廷始终没有公布如何处置董卓余部的方案。
与此同时，朝廷将尽杀凉州人（董卓是凉州人，其部众也多为凉州人）的谣言哗然四起，董卓旧部余党更是人人不能自安。
董卓阵营的谋士贾诩登高一呼：“不如相率而西，以攻长安，为董公报仇！”于是这些人由失措而惊恐，由惊恐想到了铤而走险。军队一路向长安，到达长安城下时已经集结了十万人。长安城应声而破，王允也在这场变乱中被杀。
接下来，比董卓素质更低的军阀们开始把持朝政，相互攻伐。所以，王允杀董卓，并没有终结历史的糟糕局面，而是让糟糕走向了更糟糕。就这样，历史进入了“后董卓时代。
