2017-12-21

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今天只看了《数据库系统原理教程》第一章(王姗、陈红,清华大学出版社,1998.7,2016年重印),很老的书,不过主要是看基础概念,倒应该不存在过时的问题。可以在实践的过程中,对照参考。每天看一点。

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此外,在实验楼(https://www.shiyanlou.com)开始学上面的MySQL 基础课程(这个学习项目主要以操作为主)

主要的优点,第一个优点,学习的过程以实际操作为主(正如网站的名字"实验"),第二个优点是无需安装开发环境,在线可以模拟数据库的运行环境(这里用的是Linux系统)

实验楼MySQL基础课程 界面

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查阅、整理了北京大学生物信息硕士、生物系本科、清华大学生物学本科、计算机科学与技术本科的培养方案。还查到了不知来源的一些生物信息本科、硕士的培养方案,聊胜于无,留做参考。之前报了一个知乎live,北大生信在读博士生讲的,也是讲生信入门的路线,最近整理一下。

因为需要系统补充(or 复习)生物信息相关学科的知识,所以先查一下培养方案,了解需要从哪些课程学起。

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还整理了密歇根大学医学院计算医学与生物信息学系的培养计划(Department of Computational Medicine and Bioinformatics,Medical school,University of Michigan)

以后翻译成中文版的。

Students in the program are required to complete at least 31 credits of course work, and some bioinformatics research.  However, Directed Research (BIOINF-599) cannot constitute more than 6 of the 31 minimum credits.

Course Work

Students are required to take at least one course in each of the following areas

Introductory Bioinformatics

Computing & Informatics

Probability & Statistics

Molecular Biology

Bioinformatics 602(Journal Club) should only be taken once in your first year.

Bioinformatics 603(Journal Club) students in this course present papers for discussion.

Research Responsibility and Ethics course (PIBS 503(link is external)).

One advanced bioinformatics course offered or cross listed by the Bioinformatics Graduate Program

One additional advanced bioinformatics course (BIOINF or not)

A note about the molecular biology requirement: Students without a molecular biology background are strongly advised to take the introductory biology course, BIOINF-523, prior to the first term of classes or before taking any graduate level molecular biology course. BIOINF-523 alone is insufficient to qualify as molecular biology. Most Introductory molecular biology courses offered by PIBS programs qualify, ask advisers if it is not listed.

A note about the statistics requirement: Master's students can take BIOSTAT -521, which does not require multivariate calculus, or STATS -412. If you are especially interested in later pursuing a Ph.D., take BIOSTAT 521 and BIOSTAT 522 or one of the probability + statistics series, either Stats STATS 425 and Stats STATS 426, or the mathematically rigorous Math 525 + Math 526PSYCH 613 and PSYCH 614, or Biostats BIOSTAT 601 and Biostats BIOSTAT 602 series. It is also possible to take Biostat BIOSTAT 601 followed by Stats STATS 426.

The program encourages students to find other courses that may meet the core area criteria. All requests to substitute courses not listed that may meet that particular core area's requirements should be addressed to the Program Directors.

A student must get a grade of "B" or better in each of the required courses. Any exceptions need permission.

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