Apache Spark GraphX 图文详解

参考文档:
http://spark.apache.org/docs/latest/graphx-programming-guide.html
http://spark.apachecn.org/#/docs/9

说明:本文是对GraphX官方文档的学习笔记,用画图的方式更好地理解图计算的一些操作。

属性图(Property Graph)是一张有向多边图(directed multigraph),顶点和边都可以有自定义的属性。顶点有编号和顶点属性,边只有属性,不过边可以连接源顶点和目标顶点。

一张图当然会有很多顶点和很多边组成,而Spark的RDD就类似于一个集合,所以图可以用。

  • RDD[(VertexID, VD)]表示一系列的顶点
  • RDD[Edge[ED]]表示一系列的边

VertexRDD和EdgeRDD是对上面两个数据结构更高级的封装。VD和ED作为Graph的类型参数表示的是顶点和边的数据;为什么在图中没有VertexID呢,因为顶点编号肯定是必须的!但是顶点数据和边数据则是自定义的。泛型就是为了自定义。所以我们可以肯定VertexRDD一定包含了VertexID,而VD是不会包含VertexID的。

class Graph[VD, ED] {
  val vertices: VertexRDD[VD]   // RDD[(VertexID, VD)] 顶点编号,顶点数据(属性)
  val edges: EdgeRDD[ED]        // RDD[Edge[ED]] 边数据(属性)
}

属性图可以用顶点表和边表来表示,边表有两个外键引用了顶点表的主键,分别表示边的源顶点和目标顶点。 顶点和边都可以有自己的属性。


示例

通过图可以获取顶点视图和边视图,除此之外还提供了triplet三元组,这样通过triplet也可以获得顶点(源顶点和目标顶点)的属性。


视图

属性图,提供的操作就是属性操作(Property Operator),可以操作顶点的属性和边的属性。
但是顶点的编号,以及边的源编号和目标编号都是不能操作的,因为更改了编号,图就完全变样了。

Triplet实际上是继承了Edge,原先的边只有srcId和destId,现在加上了srtAttr和destAttr,信息更加丰富。

class Graph[VD, ED] {
  def mapVertices[VD2](map: (VertexId, VD) => VD2): Graph[VD2, ED]
  def mapEdges[ED2](map: Edge[ED] => ED2): Graph[VD, ED2]
  def mapTriplets[ED2](map: EdgeTriplet[VD, ED] => ED2): Graph[VD, ED2]
}
  • mapVertices:对图的Vertices做操作,原图的VD类型通过map函数转换为新图的VD2类型
  • mapEdges/mapTriplets:对图的Edges做操作,原图的ED类型通过map函数转换为新图的ED2类型


    属性操作
  • outerJoinVertices:顶点本身是一张表,主键是顶点编号,其他属性作为普通的列比如名字和职位组成VD:(String,String),
    可以对顶点边转换成新的表,不过新的表的主键也一定仍然是顶点编号,其他列比如只有一个:统计顶点的入度,VD=Int
    将原图(的顶点表)和新的顶点表进行out-join,相同顶点编号作为一行,剩余一起join的是原表的列,和新表的列。

sql语句表述

SELECT v.id, v1.attr, v2.outDegree from vertices v1
OUT JOIN (
  select id, count(outDegrees) as outDegree from vertices
) v2 ON v1.id = v2.id

scala代码表述

  val inputGraph: Graph[Int, String] = graph.outerJoinVertices(
        graph.outDegrees)((vid, _, degOpt) => degOpt.getOrElse(0))
outerJoinVertices

下面的示例是构造一张PageRank图的初始步骤,每条边包含权重(入度的倒数),每个顶点初始值为1.0。
示例

PageRank示例
    //Join 操作
    //构造一个新图,顶点属性是出度
    val inputGraph: Graph[Int, String] = graph.outerJoinVertices(
        graph.outDegrees)((vid, _, degOpt) => degOpt.getOrElse(0))
    inputGraph.triplets.collect.foreach(println(_))
    inputGraph.vertices.collect.foreach(println(_))
    inputGraph.edges.collect.foreach(println(_))
    println("----------------------")

    //根据顶点属性为出度的图构造一个新图,依据PageRank算法初始化边与点
    val outputGraph: Graph[Double, Double] =inputGraph.mapTriplets(
        triplet => 1.0 / triplet.srcAttr).mapVertices((id, _) => 1.0)
    outputGraph.triplets.collect.foreach(println(_))
    outputGraph.vertices.collect.foreach(println(_))
    outputGraph.edges.collect.foreach(println(_))
    println("----------------------")
  • joinVertices详解:
    joinVertices
  • outJoinVertices详解:
    outJoinVertices
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