conda管理虚拟环境
命令
创建环境
conda create -n rna-seq sra-tools fastqc cutadapt trimmomatic star hisat2 samtools subread htseq
以上命令为创建名称为rna-seq的虚拟环境，并安装sra-tools等包。
查看环境
conda info -e 查看安装了哪些环境
激活环境
source activate rna-seq（rna-seq为环境名称，下同）
关闭环境
source deactivate rna-seq
删除环境
conda remove --name rna-seq --all
conda remove -n rna-seq -a
以上两个命令等价，双减号后面跟单词形式，单减号后面跟字符形式
查看包
conda list
查看当前环境下已安装的包
conda list -n rna-seq
查看rna-seq环境已安装的包
安装包
conda install -n rna-seq fastqc
安装fastqc包到rna-seq环境，如果没有-n ran-seq，则安装到当前环境
升级包
conda update -n rna-seq fastqc
升级ran-seq中的fastqc包
删除包
conda remove -n rna-seq fastqc
删除ran-seq中的fastqc包
备注
以上命令为Linux操作系统
