运行到这里遇到一个巨坑 sambamba image.png image.png bismark erro image.png bismark DNA甲基化测序比对-bisulfite-seq image.png 好吧本来想将两个repeat的bam文件合到一起,想着sambamba快一些,还脑残的进行了排序,结果自然而然merge后得到的bam文件运算时候就报错了。GG又折腾了一天。对于合并bam文件网上搜到的答案是尽量使用samtools cat, 而不影响原本bismark比对得到的bam文件的排布。